[ad_1]

مدل سازی پروتئین سه بعدی نشان می دهد که چرا COVID-19 برخی حیوانات را آلوده می کند اما برخی دیگر را آلوده نمی کند

مدل سه بعدی ساختار دامنه اتصال گیرنده SARS-CoV-2 (به رنگ آبی) ، در حال تعامل با گیرنده ACE2 انسان (به رنگ خاکستری). اسیدهای آمینه مهم برای تعامل ، که فقط در گونه های جانوری حساس به COVID وجود دارد ، با رنگ زرد برجسته می شوند. قندهای مربوط به پروتئین به رنگ صورتی نشان داده می شوند. اعتبار: رودریگز و دیگران 2020 (CC-BY 2.0)

برخی از حیوانات بیشتر از دیگران در معرض عفونت COVID-19 هستند و مطالعات جدید نشان می دهد که این ممکن است به دلیل ویژگیهای متمایز پروتئین موجود در سطح سلولهای حیوانی باشد. جوآو رودریگز از دانشگاه استنفورد ، کالیفرنیا و همکارانش این یافته ها را در مجله دسترسی آزاد ارائه می دهند زیست شناسی محاسباتی PLOS.

تحقیقات قبلی نشان داده است که همه گیری کنونی از زمانی شروع شده است که ویروس عامل COVID-19 ، SARS-CoV-2 ، از خفاش ها یا پانگولین ها در انسان پریده است. به نظر می رسد برخی دیگر از حیوانات مانند گاو و گربه به COVID-19 حساس هستند ، در حالی که بعضی دیگر مانند خوک و مرغ چنین نیستند. یک باغ وحش حتی عفونت در ببر را گزارش کرده است. با این حال ، مشخص نبود که چرا برخی از حیوانات ایمن سازی شده اند و برخی دیگر نیز ایمن نشده اند.

برای پاسخ به این سوال ، رودریگز و همکارانش در اولین مرحله از عفونت ، هنگامی که پروتئین SARS-CoV-2 “پرید” به پروتئین گیرنده “ACE2” در سطح سلول حیوانی ، به دنبال سرنخ هایی گشت. آنها از کامپیوترها برای شبیه سازی ساختارهای سه بعدی پروتئین ها و بررسی چگونگی تعامل پروتئین سنبله با گیرنده های ACE2 در حیوانات مختلف استفاده کردند – شبیه بررسی اینکه قفل ها با یک کلید خاص مطابقت دارند.

محققان دریافتند که “قفل” های ACE2 برخی از حیوانات با “کلید” ویروسی مطابقت بیشتری دارد و این حیوانات از جمله انسان مستعد ابتلا به عفونت هستند. اگرچه تقریبی است ، اما شبیه سازی ها ویژگی های ساختاری خاصی را برای گیرنده های ACE2 این گونه های حساس تعیین می کنند. این روش سنجش نشان می دهد که گونه های دیگر ایمن سازی می شوند زیرا گیرنده های ACE2 آنها فاقد این مشخصات هستند و منجر به تداخل ضعیف تری با پروتئین های سنبله دار می شود.

این یافته ها ممکن است به توسعه استراتژی های ضد ویروسی کمک کند که از “قفل” های مصنوعی برای گرفتن ویروس و جلوگیری از تعامل آن با گیرنده های انسانی استفاده می کنند. آنها همچنین می توانند به بهبود الگوهای نظارت بر میزبان حیوانات که از طریق آن ویروس می تواند به طور بالقوه به انسان برسد ، کمک کند و در نهایت از شیوع آینده جلوگیری کند.

“با تشکر از داده های دسترسی آزاد ، پیش چاپ ها و نرم افزارهای دانشگاهی که به طور رایگان در دسترس است ، ما از این سوال که ببرها می توانند COVID-19 را بگیرند به سمت ایجاد مدل های 3-D از ساختارهای پروتئینی سوق داده ایم که توضیحات احتمالی در مورد چرایی این مسئله را فقط در عرض چند هفته ارائه می دهد.” رودریگز می گوید.

تیم وی قصد دارد همچنان به اصلاح ابزارهای محاسباتی مورد استفاده در این مطالعه بپردازد.


دهها پستاندار ممکن است به SARS-CoV-2 حساس باشند


اطلاعات بیشتر:
Rodrigues JPGLM ، Barrera-Vilarmau S ، MC Teixeira J ، Sorokina M ، Seckel E ، Kastritis PL ، و دیگران. (2020) بینش در مورد انتقال متقابل SARS-CoV-2 از مدل سازی ساختاری. PLoS رایانه Biol 16 (12): e1008449. doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008449

تهیه شده توسط کتابخانه علمی عمومی

نقل قول: مدل سازی پروتئین 3-D نشان می دهد که چرا COVID-19 برخی حیوانات را آلوده می کند اما برخی دیگر را آلوده نمی کند (2020 ، 3 دسامبر) ، در تاریخ 3 دسامبر 2020 از https://phys.org/news/2020-12 بازیابی می شود -d-protein-covid-infects -animals.html

این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. به جز هر معامله عادلانه ای به منظور معاینه خصوصی یا تحقیق ، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تولید نیست. این محتوا فقط برای اطلاع رسانی ارائه شده است.



[ad_2]

منبع: moshaverh-news.ir